Ponpes Al Zaytun mempunyai visi dan misi yaitu perbaikan kualitas pendidikan umat yang tersimpul di dalam motto: Al-Zaytun Pusat Pendidikan Pengembangan Budaya Toleransi dan Perdamaian Menuju Masyarakat Sehat, Cerdas, dan Manusiawi.
Para santri Al Zaytun diarahkan pada aliran Islam yang terbuka, toleran dan menghindari perpecahan antar sesama manusia.
Saat ini, pesantren ini dipimpin oleh Prof. Dr. Dr. (H.C.) Abdussalam Rasyidi Panji Gumilang, MP yang merupakan alumni Pondok Pesantren Gontor.
Baca Juga: Niat Sholat Idul Fitri sebagai Imam dan Makmum, Jangan Sampai Lupa Ya
Ciri khas pendidikan
Sholat Id di Ponpes Al Zaytun.
Terdapat ciri khas tersendiri di Ponpes Al Zaytun yang berdiri di Blok Sandrem, Desa Mekarjaya, Kecamatan Gantar, Kabupaten Indramayu, Jawa Barat.
Ciri khas tersebut meliputi sistem pendidikan terpadu, pesantren spirit but modern system, basthotan fi al-'ilmi wa al-jismi, international language hingga boarding school.
Proses pendidikan di tempat ini didasarkan pada sebuah sistem terpadu yang mampu mengarahkan peserta didik mengikuti suatu skema pendidikan yang disebut dengan one pipe education system.
Baca Juga: Hukum Meninggalkan Sholat Jumat bagi yang Sudah Sholat Id di Pagi Hari
Sistem dimulai dari level paling asas (elementary) sampai dengan level tertinggi dalam dunia akademik (doctoral) dalam sebuah sistem yang terpadu. Nantinya, proses akan mengkombinasikan kereligiusan, science technology, agriculture, sports, arts, culture dan information technology.
